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對(duì)合成的引物先進(jìn)行稀釋,現(xiàn)將方法簡(jiǎn)單敘述如下::OligoDNA中的每個(gè)脫氧核苷酸堿基的平均分子量近似為,則一條OligoDNA的分子量=堿基數(shù)×。例:您得到一管標(biāo)為5OD260的20merOligoDNA分子量=20×質(zhì)量數(shù)=5×33=165μg摩爾數(shù)=165/6490=μmol=25nmol若加除菌雙蒸水400μl溶解,則濃度為25nmol/400μl=μ,這是指在1ml體積1cm光程標(biāo)準(zhǔn)比色皿中,260nm波長(zhǎng)下吸光度為1A260的Oligo溶液定義為1OD260單位,根據(jù)此定義,1OD260單位相當(dāng)于33μg的OligoDNA,您可以根據(jù)此數(shù)據(jù)和您的OligoDNA分子量,計(jì)算得到摩爾數(shù)以計(jì)算不同摩爾濃度的溶液。3.引物序列的分子量計(jì)算公式如下:MW=(A堿基數(shù)×312)+(C堿基數(shù)×288)+(G堿基數(shù)×328)+(T堿基數(shù)×303)-61例如:引物TGGGCGGCGGTTGGTGTTACGA=1C=3G=11T=6MW=(1×312)+(3×328)+(6×303)-61=65414.裝有引物的eppendorf管一般保存于-20℃,臨用前稀釋。5.由于OligoDNA呈很輕的干膜狀附在管壁上,打開(kāi)時(shí)極易散失,所以打開(kāi)管子前請(qǐng)先離心10,000rpm,1min,然后再慢慢打開(kāi)管蓋。6.在裝有引物的eppendorf管內(nèi)加入100-500μl雙蒸水,蓋上管蓋,充分上下振蕩5-10分鐘,再次離心10,天津進(jìn)口RNA合成儀哪家比較好,000rpm,天津進(jìn)口RNA合成儀哪家比較好,天津進(jìn)口RNA合成儀哪家比較好,1min。7.計(jì)算原引物管primer的濃度。
用于和DNA或RNA結(jié)構(gòu)類似的寡核苷酸合成的自動(dòng)化儀器,即是DNA合成儀。通常用于固相合成法,每次在長(zhǎng)的寡核苷酸鏈上接入一個(gè)核苷酸。加入每一個(gè)核苷酸均通過(guò)相同的化學(xué)反應(yīng)和相應(yīng)的嘌呤或嘧啶堿基衍生物作用。儀器不同,所用化學(xué)反應(yīng)和操作細(xì)節(jié)也會(huì)隨之發(fā)生變化。DNA合成的磷酸酰胺法得到了非常***的應(yīng)用。結(jié)構(gòu)和性能1、輔助真空隔膜形成一個(gè)圓頂小空隙為適當(dāng)運(yùn)行閥塊的關(guān)鍵。每次打開(kāi)電磁閥時(shí),在隔膜的螺線管一側(cè)形成輔助真空,使一圓頂空隙形成在隔膜。2、合成柱起始在一次性的柱子中裝有結(jié)合在載體(一般為CPG)上的核苷酸,不僅有柱體,而且還有2個(gè)固定過(guò)濾板和2個(gè)接頭,由惰性材料制成所有的部件。3、流路節(jié)流閥小量的試劑長(zhǎng)期在流路節(jié)流閥中結(jié)晶,會(huì)阻塞流路。4、廢液和排氣廢氣提高排氣管往適當(dāng)?shù)呐艢庋b置導(dǎo)入,廢液瓶能夠在在低于儀器的附近工作臺(tái)上或者合成儀附近的地板上放置。其是一個(gè)空立著的10L的聚苯乙烯容器,為大多數(shù)化學(xué)試劑輸送的終點(diǎn)站。5、電導(dǎo)池一空隙隔開(kāi)的兩個(gè)電極組成了電導(dǎo)流動(dòng)池,應(yīng)用一小電壓在空隙之間。其設(shè)計(jì)是為了對(duì)每個(gè)DNA合成循環(huán)內(nèi)釋放的DMT陽(yáng)離子的總電導(dǎo)進(jìn)行測(cè)定。6、電池DNA合成儀通常帶有能夠使用幾年的鋰電池。
展開(kāi)全部一、按照不同用途,DNA合成儀可分為實(shí)驗(yàn)室型,工業(yè)型和大規(guī)模合成三種主要類型。1,實(shí)驗(yàn)室型:主要指合成通量較小,且單柱合成產(chǎn)物為10-1000nmol的DNA合成儀,一般為合成柱數(shù)低于48柱(含)的DNA合成儀,主要適用于化學(xué)生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室,或某些剛起步的商業(yè)機(jī)構(gòu)。該類型DNA合成儀品牌較多,包括已停產(chǎn)的ABI391,394,3400,3900,BECKMANoligo-1000,及仍然量產(chǎn)的polygen10柱,12柱,mermade4,6,8,12,48柱;BIOSSETASM-800,AZCOOLIGO-8等。2,工業(yè)型工業(yè)型合成儀,主要指合成通量大,且單柱合成產(chǎn)物為10-1000nmol的DNA合成儀。工業(yè)型合成儀常見(jiàn)的合成柱數(shù)為96柱、192柱,384柱或更多合成柱數(shù)的合成儀較為鮮見(jiàn)。主要適用于大型實(shí)驗(yàn)室,公用實(shí)驗(yàn)平臺(tái)及商業(yè)合成機(jī)構(gòu)。國(guó)內(nèi)主要的商業(yè)合成機(jī)構(gòu)如上海生工,北京賽百盛,上海捷瑞,華大基因,金斯特,金維斯等。該類型DNA合成儀較實(shí)驗(yàn)室型品牌相對(duì)較少,常見(jiàn)的品牌有美國(guó)biolytic,丹麥oligomaker,美國(guó)mermade,美國(guó)polyplex等。在歐洲,polygen96柱合成工作站及384柱合成塔也是較常見(jiàn)的工業(yè)型合成儀之一。3,大規(guī)模合成型大規(guī)模合成型主要指單柱合成產(chǎn)物量可達(dá)數(shù)克,甚至數(shù)公斤的合成儀,主要用于原料藥制備等科研或商業(yè)用途。
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